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管裝培養基的資料分析

更新時(shí)間:2019-06-24  |  點(diǎn)擊率:1219
   生物藥工業(yè)化生產(chǎn)中,管裝培養基配方中通常含酵母提取物和蛋白胨等添加物。盡管政策鼓勵公司使用化學(xué)限定性培養基以減少哺乳動(dòng)物細胞培養工藝中的變量,許多微生物和哺乳動(dòng)物細胞培養工藝中仍繼續使用生物添加物作為管裝培養基配方或補料。據Sheff ield Bioscience (Kerry, Inc.)報道,已獲批的哺乳動(dòng)物細胞–衍生的生物治療產(chǎn)品中至少有六成在生產(chǎn)中使用了生物添加物。
 
  工藝開(kāi)發(fā)過(guò)程中,難以確定哪種添加物適合于某種特定應用,因為添加物的復雜組分和多樣性。多變量分析(MVA)技術(shù)越來(lái)越廣泛地應用于幫助公司了解他們的生物制藥產(chǎn)品和生產(chǎn)工藝的復雜性。
 
  技巧包括基于統計的工藝建模、傳感器校準和工藝可比性。
 
  多變量分析(MVA)技術(shù)本質(zhì)上是一種統計回歸技術(shù),試圖通過(guò)捕捉新的正交變量或稱(chēng)為主成分(PCS)的可變性來(lái)對實(shí)際變量的可變性作出解釋。相關(guān)實(shí)際變量之間的相關(guān)性允許使用數量較少的主成分來(lái)捕捉建模和作出預計,從而對更大量的數據集的原始信息作出分析。
 
  這里,主成分分析法(PCA)用于對來(lái)自六十五種無(wú)動(dòng)物成分(ACF)生物添加物的組合數據變化,進(jìn)行數據捕獲和建模。由此產(chǎn)生的模型用于研究?jì)煞N生物添加物的批間變化,并對市場(chǎng)上的新產(chǎn)品進(jìn)行評估。本文展示定量結構-活性關(guān)系(QSAR)方法來(lái)研究組分與培養表現和產(chǎn)品蛋白含量之間的關(guān)系。
 
  這里推薦定量結構-活性關(guān)系(QSAR)為基礎的方法,使用主成分空間的因子設計來(lái)評價(jià)添加劑組成和細胞培養表現之間的聯(lián)系。由生物添加物衍生的主成分分析法(PCA)分數和由定量結構-活性關(guān)系(QSAR)方法選擇出來(lái)的生物添加物的細胞培養物的模擬性能數據組成的訓練集,被用來(lái)創(chuàng )建偏小二乘(PLS)模型。然后PLS模型可以用于預測不屬于訓練組的生物添加物的性能。
 
  管裝培養基材料與方法
 
  數據源和數據匯編
 
  145個(gè)生物添加物的化學(xué)成分數據,可從公開(kāi)來(lái)源獲得,由OxoD,Becton Dickinson和Sheff ield Bioscience公布。
 
  這些數據代表了每種生物添加物的典型組成,并且可以被認為是從許多生產(chǎn)批次、子樣本或分析中得出的平均值。每個(gè)生物添加物的化學(xué)組成在電子表格中被編輯并注釋以方便后續的分析。注釋里包含供應商、原材料來(lái)源、產(chǎn)品類(lèi)型、消化法和ACF狀態(tài)。管裝培養基在供應商之間的測量單元不同的情況下,這些測量單元被標準化,使得數據集具有可比性。管裝培養基選擇65個(gè)無(wú)動(dòng)物成分(ACF)生物添加物組成的訓練數據集,每個(gè)數據集有59個(gè)變量來(lái)描述每種生物添加物的物理化學(xué)數據、分子量分布和自由氨基酸總量。表2列出了這里使用的變量。
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